UE BIOMED

Imagerie Biologique et Médicale - Biomedical imaging (BIOMED)

2025 - 2026

Cours le jeudi matin à 8h30 - Lectures on Thursday morning (8:30am)
Programme :
- First part: Medical Imaging (Isabelle Bloch)
- 25/9 : Introduction, principes de l'imagerie par rayons X, scanner, imagerie nucléaire, imagerie ultrasonore, imagerie par résonance magnétique, électrophysiologie -- Introduction, principles of several medical imaging methods (X-rays, scanner, nuclear imaging, ultrasound, MRI...)
- 2/10 : Principes d'imagerie (suite) -- Imaging principles
- 9/10 : Reconstruction tomographique - Tomographic reconstruction
- 20/10 (Monday!) : Recalage - Registration -- Applications
- 23/10 : Filtrage et segmentation : TP - Practical work on filtering and segmentation
- 6/11 : Filtrage et segmentation : TP - Practical work on filtering and segmentation
- 20/11 : Intelligence artificielle en imagerie médicale - Artificial intelligence in medical imaging
- 27/11 - 8h30-10h30 : Examen réparti 1 (sur les cours en imagerie médicale) - First exam on the courses on medical imaging - Seul document autorisé : une feuille A4 recto-verso de notes / Only on recto-verso sheet of notes authorized
- Second part: Biological Imaging
- 4/12: Détection et suivi de particules fluorescentes (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours puis 2h TP - Logiciel à installer avant le TP : ICY + Eclipse
- 11/12 : Introduction à l'imagerie biologique, microscopie photonique, vidéomicroscopie, microscopie confocale (CLSM) et microscopie bi-photonique, super-résolution (Philippe GUILLAUD)
- 18/12 : no lecture - work on literature review
- 8/1 Microscopie électronique et traitement d'images (Catherine VENIEN-BRYAN)
- 15/1 : Colocalisation, segmentation et suivi de cellules (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours puis 2h TP
- 22/1 : Microscopie confocale et spinning-disk (Romain MORICHON) - CISA, Faculté de Médecine de Saint Antoine, 6ième étage, pièce 608, 27 rue de Chaligny, 75012 Paris
- 5/2 : Analyse histologique (Vannary MEAS-YEDID) - 2h Cours +2h TP
- 12/2 : examen réparti 2: oral presentations of literature review.

Examen : la note sera composée des notes des deux examens répartis, et des comptes-rendus de TP

Course material in English:
- Introduction to the course
- Introduction and principle of the main acquisition methods
- Tomographic reconstruction
- Image registration
- Applications: Cardio-vascular imaging
- Applications: Mammography
- Artificial Intelligence and Medical Imaging
- Biological imaging (some of the slides are in French)
- Lecture of Catherine Venien-Bryan

Example of a previous exam (1st part)